工程力學研究所籌建于1952年，正式成立于1954年，最初定名為中國科學院土木建筑研究所。
　　1954-1962研究所從事建筑材料、土壤力學、工程結構和建筑設計的研究。主要的工作是材料實驗、土壤實驗和新建筑材料的研究。同時，著重于正在發展中的研究領域，諸如鋼筋混凝土和預應力鋼筋混凝土、地震工程、結構安全度和黃土的工程性質等。
　　1962年更名為中國科學院工程力學研究所。研究領域隨之調整，主要包括地震工程、核反應堆結構力學、土壤力學、沖擊與振動和特殊混凝土材料及其動力性能的研究。
　　1970-1984，受國家地震局和中國科學院雙重**。
　　1984年4月，改由國家地震局**，所名隨之改為國家地震局工程力學研究所。為適應國民經濟迅速發展和國內外對防震減災工作的迫切需要，確定以地震工程和安全工程為主要研究方向。
　　1998年4月，隨著國家地震局更名為中國地震局，所名改為中國地震局工程力學研究所。
　　工程力學所為適應國家建設的需要不斷進行調整，在各個階段都做出了重要的貢獻。特別是在地震工程領域，在幾乎所有方面都是我國的先驅，取得了一系列重要成果，在國家經濟建設中發揮了重大作用，在國際上贏得很高的學術聲譽。
　　1978年－2003年，共獲科研方面獎項308項，其中***19項、省部級獎136項。
　　劉恢先教授擔任**任所長。繼劉恢先教授之后，胡聿賢、謝君斐、謝禮立、馮啟民、齊霄齋教授先后擔任所長，現任所長是王自法教授。
　　2003年6月末，根據國家批準的對公益性研究所的改革方案，工程力學研究所在中國地震局的直接**和組織下，在國內外公開招聘工程力學研究所所長。曾在日本獲得博士學位、在美國工作的王自法經過競聘擔任現任所長。
　 改革后，機關由原有的9個處辦，調整為兩辦兩部：所務辦公室、科技發展部、人力資源與計劃財務部、黨群和離退休工作辦公室；研究室由原有的10個，組建為7個：工程地震與強震動觀測研究室、基礎設施抗震研究室、城市與工程防災研究室、信息技術與工程材料研究室、巖土工程研究室、結構工程研究室、測量儀器研究室。同時設有科技雜志社、圖書館、財務室等科研輔助部門。黑龍江國振建筑工程研究院、儀器廠、后勤管理中心，實行企業化管理，政策上給予支持。為了國際國內交流的需要，將在北京燕郊建立國家數字強震動臺網中心，現已開工興建。
　　為了將研究所的科研成果快速地轉化為生產力，成立了哈爾濱威波瑞科技有限公司，將科研成果積極推向科技市場，為國家經濟建設服務。
　　通過改革，調動了全所職工的積極性，向建立國際**研究所的目標，不斷努力前進。