中國科學院沈陽自動化研究所成立于1958年11月。成立之初被稱為遼寧電子技術研究所，1960年4月更名為中國科學院遼寧分院自動化研究所，1962年至1972年的名稱為中國科學院東北工業自動化研究所，1972年起正式定名為中國科學院沈陽自動化研究所。