二氧化碳是水中存在較多的雜質，通常情況下是以游離狀態存在；水中存在的大量碳酸氫根在pH低時，也是以二氧化碳游離狀態存在的。于是產生了碳酸平衡問題，反應式如下：

CO₂+H₂O=H⁺+HCO₃^-=2H⁺+CO₃^2-

因此，水中二氧化碳越多，生成H+越多，水的pH值越低，產生酸性的腐蝕性水，破壞了碳鋼表面生成的保護膜引起碳鋼腐蝕。其腐蝕的化學反應如下：

2CO₂+Fe(OH)₂=Fe(HCO₃)₂

4Fe(HCO₃)₂+O₂+2H₂O=4Fe(OH)₃+8CO₂

如果除鹽水中進入二氧化碳，水的電導率即會上升，腐蝕性增大。因此除鹽水箱應當有防止大氣中二氧化碳溶入水箱的措施，如用N2或其他惰性氣體在水箱頂部空間進行保護，可以防止二氧化碳污染純水水質。

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